Софийската духовна семинария „Св. Йоан Рилски“ учениците имат възможност да развиват своите дарования и извън учебните часове чрез разнообразни извънкласни занимания. Сред най-популярните са кръжоците по иконопис, дърворезба, компютърни науки, история и астрономия, които подпомагат творческото и духовното израстване на младежите.

Активно се развиват и спортните дейности – футболният отбор на Семинарията редовно участва в ученически турнири, а спортната зала и просторният двор осигуряват отлични условия за физическа подготовка. Особено място заема и Семинарският хор, който участва в богослужения, концерти и национални събития, представяйки училището на високо художествено и духовно ниво.

Извънкласните занимания са важна част от възпитателната мисия на Семинарията, насочена към изграждане на цялостна личност – образована, трудолюбива и отговорна пред Бога и обществото.